Vedení organizace

Ing. Pavel Habarta, MBA, pověřen řízením Správy železniční dopravní cesty, státní organizace

Úsek generálního ředitele

Kancelář generálního ředitele - bez vedoucího zaměstnance
Odbor interního auditu - Ing. Věra Chamasová
Odbor bezpečnosti - Mgr. Petr Brázda
Odbor šetření mimořádných událostí - Ing. Jiří Stránský
Odbor personální - Ing. Mojmír Bakalář

Úsek ekonomický

Náměstek GŘ pro ekonomiku: Ing. Vladimír Filip
Odbor nákupu a veřejných zakázek - Bc. Jiří Svoboda
Odbor finanční - Ing. Petr Tauber
Odbor ekonomiky a kontrolingu - Ing. Stanislav Brablík
Odbor majetkový a správního - Ing. Jakub Červenka
Odbor informatiky - Ing. Michal Merta, MBA

Úsek provozování dráhy

Náměstek GŘ pro provozování dráhy: pozice neobsazena
Odbor smluvních vztahů - JUDr. Hana Honzáková
Odbor provozování dráhy - Ing. Pavel Skála, pověřen řízením úseku provozování dráhy
Odbor JŘ a kapacity dráhy - Ing. Miloš Houska
Odbor řízení RCP - Ing. Miroslav Jasenčák
Odbor operativního řízení provozu - Ing. Martin Koleš

Úsek provozuschopnosti dráhy

Náměstek GŘ pro provozuschopnost dráhy: Ing. Vojtěch Kocourek, Ph.D.
Odbor provozuschopnosti - Ing. Ivan Jágr
Odbor traťového hospodářství - Ing. Jiří Kozák
Odbor automatizace a elektrotechniky - Ing. Josef Šibrava

Úsek modernizace dráhy

Náměstek GŘ pro modernizaci dráhy: Ing. Jiří Martínek
Odbor investiční - Ing. Jarmila Ozimá
Ředitel odboru strategie - bez vedoucího zaměstnance, řízením pověřen Ing. Zdeněk Zouhar